有些肺病变位于肺尖不随呼吸移动。有些病变大，尽管有呼吸偏移它们都几乎不可能被穿刺活检针错过。
许多病变在1到2厘米范围，而且在膈肌附近，则可能需要耗时20分钟，经历非常沮丧的努力和多个胸壁穿刺，以试图调整活检针与目标病变之间正确的方向。经常的情况是在肺实质内调整针的几何方向，前提是这种方向的调整不能幅度太大。
CT轴向扫描直径1cm左右病变成像才较为清楚。这种小病变在膈肌附，正常呼吸过程中可以很容易地上下移动4到5厘米。仅要求病人屏住呼吸，也不一定会成功。
通常在患者屏住呼吸后，在CT轴向扫描的病变水平穿刺针初始入肺，此时患者需再次呼吸，当患者重复屏住呼吸时，上下、前后调整穿刺针方向二次进针。不断重复直至穿刺针进入靶病变。
有时，下次病人屏住呼吸时，因躯干偶然移动或膈肌运动不足，病变不再可见，而且肋骨、叶间裂或膈肌出现在进针的方向上，就不能保证穿刺的安全和可靠性性。如果选择一个新的皮肤进入部位来适应这种变化，患者又不知道该做什么来帮助介入放射科医生，可能会在随后的呼吸中恢复到第一个屏住呼吸的姿势。原有的CT轴向扫描病变已经不能被覆盖。
如果病人服用了镇静剂，这个过程就会变得更加困难。手术的成功或失败可能会变成更多的偶然问题，而不是原先的逻辑或计划，反复努力将针调整到对准的时刻，就变成一个不断重复的扫描过程以便有很高的概率击中病变。即使每个有经验的穿刺医生都不可避免的经历。具有较高技术挑战的病变可以通过以下方法来解决：
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训练病人有可控的呼吸
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定位患者以减少活动和术后漏气的可能性
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选择具有最理想特性的目标
病人作为伙伴在促进活检成功
与其他类型的图像引导活检（如胃镜，支气管镜活检，没有被活检病变的快速移动，也没有潜在短期住院的风险）不同，经皮穿刺肺活检最重要的过程是穿刺之前花时间解释通常的活检病人经验。
每个病人在遵循指示和保持给定位置的能力上都略有不同。接受肺活检的患者有些是身体虚弱、呼吸困难、老年人关节活动受限、听力困难，甚至睡眠不足。
患者位置的影响
俯卧位胸壁运动最少，仰卧位其次，侧卧位胸壁运动最大。
后入路肺部活检需要真正的俯卧姿势，对患者来说是一种挑战。除非有专门的头部支持，才能保持脸朝下并保持舒适的呼吸。俯卧斜位可以使头部转向一侧，可能需要手臂放置在肩膀水平以下，移动肩胛骨向两侧以便显露进入针道。活检时俯卧位与气胸风险相关。【 Nakamura 2011】
仰卧位患者膝盖下的楔子通常更舒服。也许有必要用胶带把乳房固定开。
侧卧位是最不理想的。随着时间的推移，患者往往会偏离这个姿势，即使臀部和膝盖会弯曲以保持稳定。
病人的手臂放在身体两侧更舒服。所有体位都应设法消除颈椎或其他关节应变、压力点和呼吸困难，因为这些问题会导致患者活动，增加手术时间和风险。
目标病变的选择（在存在多个潜在目标时）
大小往往不是选择目标时最重要的因素。在一个合作的患者中，选择上肺病变，因为上肺通过呼吸移动的幅度小。然而，即使是1-2cm的病变，位于下肺即为不良病变目标，因为在最初的过胸壁、过脏层胸膜穿刺或在获得后续穿刺样本的这三个过程中的某个时刻，呼吸运动导致针尖/道与病变重合失调（misregistration）的可能性很高。
一个大的从肺门中心向肺周边延展，呈楔形或不规则形状，真正的病变以相同密度的“埋”在其中毗邻肺实质中，在视觉上并不能识别正确的病变位置，之前的PET-CT若显示有高代谢的位置，就是经皮肺病变活检的理想病变。PET/CT病变更高的代谢活动增加了获得活检的异常组织的机会。
肺外周位置的病变大大减少了穿刺大血管的机会和穿刺过程中针漂移/重定向的机会。在进入时避免肺充气的能力降低了发生气胸的几率。
肺中最容易活动的部分是横膈肌周围（下肺）。
The part of the lung most difficult to expand after a pneumothorax is the lung apex.
气胸后肺最难以复张的部分是肺尖。
为了防止或减少气胸，肺下叶上部的区域与膈肌周围病变和肺下叶尖部的病变比较，这部分的区域在患者仰卧位的时候由于受重力影响移动相对少。
In a patient with multiple lesions and prior invasive thoracic procedure, the side on which prior surgery was performed should be selected for biopsy.
对于有多发性病变且既往有侵入性胸部手术的患者，应选择既往进行过手术的一侧进行活检。
Pleural adherence can increase due to scarring and reduce the chance of a pneumothorax.
胸膜粘附可因瘢痕形成而增加，并减少发生气胸的机会。
Puncturing via the thoracotomy scar itself should be avoided, however, because the hard tissue can interfere with needle manipulation.
然而，应该避免通过开胸疤痕本身进行穿刺，因为硬组织可能会干扰针的操作。
It cannot be stressed enough that the morphology of the area of concern is a key feature when contemplating lung biopsy.
需要强调的是，在考虑肺活检时，所关注区域的形态是一个关键特征。
Benign round atelectasis or even "standard non-round atelectasis" can fit of all of the criteria of the optimal "lesion" as described above, including that of being very hypermetabolic on PET, as could a region of parenchymal fibrosis.
良性圆形肺不张或甚至标准非圆形肺不张可符合所有最佳病变标准，包括PET代谢非常高，以及实质纤维化区域。
However, biopsying such abnormalities either with or without an actually associated mass almost never yields clinical benefit.
然而，活检这种异常，无论是否有实际相关的肿块，几乎都不会产生临床效益。
Only true nodules/masses are likely to yield any useful material on pathologic review.
只有真正的结节/肿块才有可能产生任何有用的病理检查材料。
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